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慕尼黑奧運發生了史上最嚴重的「黑色九月」事件，八名巴勒斯坦遊擊隊恐怖份子，於九月五日侵入奧運村，槍殺以色列職員和選手，對一向標榜友誼、和平的奧運會，蒙上一層負面的陰影，造成極大的傷害。
巴遊恐怖份子先槍殺了一名以色列運動員及一位角力教練後，又挾持九名以色列運動員做人質，並向以色列當局喊話要求釋放政治犯。經過二十小時談判後，西德警方與巴遊恐怖份子在費爾德布魯克機場發生激烈槍戰，不料巴遊竟將被綑綁的九名人質炸死，最後巴遊五人遭擊斃，三名被俘一人逃亡。總計在這場衝突中共造成十一名以色列隊職員遇害，西德警察及直昇機員各一人喪生，造成奧運會有史以來最大悲劇。
德國在二次大戰後國力復甦，再度成為全球經濟強國，相隔三十六年後再一次承辦奧運，為了增加奧運會生動感，籌備會想出利用吉祥物來帶動氣氛，於是奧運史上第一個奧運吉祥物在慕尼黑誕生它是一隻名叫瓦爾迪的小狗，由藍、綠、紅、橙及淡紫等色拼接而成。而瓦爾迪的出現在當時受到愛狗一族的熱烈回應。成為奧運場上及觀眾最受喜愛的紀念品，此後的各屆奧運吉祥物，均成為奧運最受歡迎的物品之一。
隨著彩色電視及照相機的逐漸普及化，大會在新聞報導方面作了相當大的投資，設置先進的新聞中心、電視大樓、廣播大樓，另在大西洋上空建立四個衛星轉播站，對全球做奧運同步實況轉播，而奧運會電視轉播權的轉讓，也為國際奧會帶來不小的收益。
西德在籌辦本屆奧運總計投入了近二十億美元的經費，在慕尼黑西北方興建八萬人容量的綜合運動場，完善的地下火車捷運系統，以及現代化的各項比賽賽場，成為名符其實的「奧林匹克公園」，各種計時器皆採用自動化設備，證明了西德的經濟實力雄厚。
本屆奧運聖火傳遞的工作，完成由選手來完成，開幕式中的點聖火儀式，是由美洲、非洲、亞洲、大洋洲的代表，陪同最後一棒西德的跑者賽恩繞場一週後點燃聖火，五大洲選手象徵奧運標誌的五環，世界團結一家的意義。本屆運動員宣示是由女選手擔任，裁判宣示也首次列入開幕式中。
本屆奧運在比賽項目上的變化並不大，只有德國創導的手球，於一九三六年柏林奧運首度列入奧運正式比賽項目後，相隔三十六年後，德國再度將手球列入；射箭自一九二○年以後被列入不再繼續的項目，經過四十二年的演進，射箭有了較完善的規則，於本屆再度列入，另外羽球及滑水首次被列為表演項目。
籃球賽則爆出大冷門，自一九三六年以來包辦所有籃球奧運金牌的美國隊，在決賽中以五十比五十一敗給蘇俄隊，痛失金牌，關鍵在終場前三秒美國罰進兩分以五十比四十九超前後，蘇俄隊比洛夫接獲隊友長傳於槍響前投進致勝的一分，反敗為勝，美國隊抗議無效，首度未能在奧運賽中拿下金牌。
游泳池中，美國泳將史必茲個人獨得游泳賽七面金牌，包括一百、兩百公尺蝶式，一百、兩百自由式，四百、八百自由式接力及四式接力七個項目，被譽為慕尼黑奧運的「水神」，同時均創下世界紀錄。
田徑場上的強國美國隊，只保住四百接力、八百、馬拉松金牌，其餘均被歐洲選手瓜分，其中又以芬蘭選手長跑表現重振雄風，韋倫在五千、一萬公尺長跑奪得金牌，蘇俄在田徑包辦九面金牌成績最佳。
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本屆奧運五環會旗下半旗為了追悼前一天被巴遊恐怖份子殺死的以色列選手們
(AFP)
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蘇聯選手歐加柯芭得到四面體操金牌
(AFP)
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澳洲游泳選手高德奪得女子200公尺自由式金牌
(AFP)
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